为增强学校主动适应经济建设和社会发展需要的活力，拓宽社会参与办学渠道，我校每年定期召开南京大学校董会。会议内容围绕学校发展工作、吸引社会力量，构建多方资源合作交流平台。校董会自1997年成立，并于2018年成立第六届校董会。校董会成员由学者、企业家、政府官员（已退休）及南京大学相关校领导组成，南京大学校长任校董会董事长。
南京大学发展委员会（南京大学教育发展基金会）根据民政部颁布的《基金会信息公布办法》及学校印发的《南京大学信息公开工作指南》等相关文件精神，制定了《南京大学教育发展基金会信息公布制度》，扎实推进信息公开工作，及时做好信息动态更新，不断提高组织工作透明度，提升组织的公信力与影响力。每年定期对上一年度通过第三方对基金会财务报表、业务开展情况等进行审计，并在基金会官网开设信息披露专栏，定期发布年度审计报告、专项信息审核报告、年度工作报告以及相关项目信息等。在由民政部主导的“慈善中国”网站公开南京大学教育发展基金会基金信息及相关年报；在基金会中心网权威发布的“2021中基透明指数FTI”排名中，南京大学教育发展基金会连续八年取得满分，在全国基金会和高校基金会中均位列第一。
